• 瓦力棋牌(中国)

    GlycoRNA（糖基化RNA）芯片

    • 简介
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    • 研究路线
    • GlycoRNA发表文献

    • 瓦力棋牌(中国) GlycoRNA芯片结合了GlycoRNA的生物化学富集和RNA定量分析方法，利用这两种方法在特异性、灵敏度和准确性方面的优势，检测GlycoRNA的表达。

      芯片涵盖了广泛的糖基化小RNA类别，包括Y-RNAs/Y-RNA片段、tRNAs、tRF&tiRNAs、pre-miRNAs、miRNAs、snRNAs/snRNA片段、snoRNAs/snoRNA片段和rRNAs/rRNA片段。

      利用这种新的方法，研究者可以取得全面的GlycoRNA表达细节，以发现和理解这类在基因调控、细胞功能和人类疾病中发挥功能的新RNA分子。

      什么是糖基化RNA（GlycoRNA）？ GlycoRNA是经过糖基化修饰的小非编码RNA，包括Y-RNA、tRNA、miRNA、snRNA、snoRNA和rRNA。诺贝尔奖得主Bertozzi实验室在2021年Cell文章中发现哺乳动物小非编码RNA可以发生糖基化修饰。

      为什么要研究GlycoRNA？ GlycoRNA已经成为癌症、心血管疾病、神经系统疾病、免疫系统疾病以及呼吸系统疾病等领域的一个新兴研究方向，为新型生物标志物和治疗应用打开了新机遇。

      如何研究GlycoRNA？GlycoRNA的检测方法，生物信息学分析工具和功能研究手段。
    • GlycoRNA可以顺利获得凝集素结合、代谢标记/点击化学、高碘酸盐氧化和醛标记（pAL）等生化方法富集，并顺利获得瓦力棋牌(中国) GlycoRNA芯片检测和定量。GlycoRNA捕获技术与GlycoRNA芯片的组合利用了这两种技术的优势：GlycoRNA捕获的高度特异性和芯片检测的高灵敏度/特异性/准确性，是现在GlycoRNA领域最先进的方法。研究人员现在可以在GlycoRNA分子作用、细胞学功能，以及相关的生物学方向和疾病领域上取得详细和全面的GlycoRNA分析信息。

      瓦力棋牌(中国) GlycoRNA芯片的一些关键优势包括：

      GlycoRNA 的全面检测  

      瓦力棋牌(中国)芯片的RNA直接标记方法，避免了RNA修饰和空间折叠对cDNA反转的阻断，使得全面检测tRF&tiRNA和tRNA成为可能，从而实现对glycoRNA的全面检测，包括Y-RNAs/Y-RNA片段、tRNAs、tRFs&tiRNAs、pre-miRNAs、miRNAs、snRNAs/snRNA片段、snoRNAs/snoRNA片段以及rRNAs/rRNA片段。由于这些小RNA具有独特的生化特性，顺利获得测序进行GlycoRNA检测需要分别进行不同类别的小RNA的专门测序，而瓦力棋牌(中国) GlycoRNA芯片可以在一次实验中同时检测以上各类小RNA。


      更高的灵敏度和可靠性
      GlycoRNA捕获步骤确保GlycoRNA检测信号确实来自糖基化的RNA，减少假阳性并增加结果的可靠性。结合GlycoRNA捕获与芯片信号检测的超高灵敏度，增强的信噪比使得低丰度的GlycoRNA也能被更好地检测到。

      适用于所有样品类型

      瓦力棋牌(中国) GlycoRNA芯片的 glycoRNA 捕获方法可检测各类细胞及临床样品类型的 glycoRNA：活细胞或非活细胞、组织、生物体液。


      新型小GlycoRNA的发现

      瓦力棋牌(中国) GlycoRNA芯片包含了基因组中的所有的小RNA种类，无论其是否已知为糖基化。如果在微阵列上检测到的GlycoRNA之前未被报道，即可将其识别为新型GlycoRNA。因此无需担心预先设计的芯片是否具有与测序相同的发现新型GlycoRNA的能力。


      前所未有的科学和医学机遇
      凭借易于获取的即用型GlycoRNA芯片分析数据，研究人员现在可以探索由这种新型GlycoRNA分子所开启的许多前所未有的科学领域：基因、细胞和分子调控中的RNA糖基化过程，以及基于GlycoRNA序列特异性的细胞表面和细胞外相互作用与通讯、新型受体配体、新的生物学过程和致病功能、新型药物靶点，以及适用于双重免疫学和序列检测的新型细胞外生物标志物。  

    • 瓦力棋牌(中国) GlycoRNA 芯片

      探针设计

      带有5’发卡帽和3’间隔区的小RNA特异性序列

      探针结合位点

      miRNA/5'tRF&tiRNA: 3' 区域
      3'tRF&tiRNA/Y-RNA/snRNA/snoRNA/rRNA-derived fragment: 全长中的特异性序列
      pre-miRNA:pre-miRNA的 loop区域

      tRNA: 成熟tRNA的反密码子环序列
      Y-RNA/snoRNA/snRNA/rRNA: 全长中的特异性序列

      探针特异性

      小RNA特异性

      芯片规格

      8x15K

       小RNA覆盖情况

      来源

       

      Human

      Mouse

      Rat

       探针总数

      7,646

      7,420

      5,312

      YsRNA (Y-RNA来源小RNA)

      10

      5

      7

      人: 文献来源

      小鼠和大鼠: 预测

      snsRNA (snRNA来源小RNA)

      4

      35

      35

      sdRNA (snoRNA来源小RNA)

      289

      1,334

      1,464

      rRF (rRNA来源小RNA)

      210

      479

      280

      人: MINTbase(V1) 

      大鼠和小鼠: 预测

      miRNA

      2,627

      1,949

      749

      miRBase(v22)

      tRF&tiRNA (tRNA来源小RNA)

      1,432

      910

      653

      tRFdb, MINTbase, GtRNADb (v18.1, 2019.08)

      公开发表的高分文献至2019

      pre-miRNA

      1,745

      1,122

      448

      miRBase(v22)

      mature-tRNA

      338

      267

      195

      GtRNAdb (v18.1, 2019.08)

      ENSEMBL (v99)

      snoRNA

      955

      1,297

      1,464

      ENSEMBL (v99)

      Y-RNA

      4

      2

      3

      RNAcentral (V24)

      RefSeq (2024.08)

      snRNA

      27

      15

      9

      rRNA

      5

      5

      5


    • Table1 差异GlycoRNA表达列表


      Symbol: GlycoRNA的名称。
      Trans_type：GlycoRNA的转录本类型。
      Precursor：GlycoRNA的前体RNA。
      Description：GlycoRNA的注释信息。
      Fold Change：表示实验组与对照组之间GlycoRNA的变化倍数。
      Regulation：两组比较的上调（up）或者下调（down）。
      P-value：评估两组GlycoRNA表达水平的差异是否具有统计学显著性的p值。

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